科学纸杯使用瓦楞纸的原因主要有两点。

首先，瓦楞纸是一种由平面纸板经过压花加工后形成的具有波纹状结构的纸板，其具有较高的强度和抗压性能，可以有效地保护纸杯内部液体不被挤压变形。

其次，瓦楞纸的波纹结构可以增加空气层的存在，使纸杯具有更好的绝缘性能，使热饮不易散发热量，冷饮也能有效避免水滴在外部，保证使用者的使用体验。