如果员工在入职半年后才交社保，公司可以采取以下补偿措施：

首先，公司可以补偿员工在半年期间应缴纳的社保费用，确保员工享受到应有的社保待遇。

其次，公司可以与员工协商，将补缴的社保费用分期扣除或者一次性支付给员工。同时，公司也应向员工解释清楚延迟缴纳社保的原因，并承担相应的责任。

最后，公司还应加强内部管理，确保新员工入职后及时办理社保手续，避免类似情况再次发生。