木棉袈裟主要讲述了达摩祖师在少林寺传授武艺，遭到武官们的嫉妒和陷害。达摩祖师历经艰险，终于逃脱了武官们的追捕，并得到一位美丽善良的女孩儿朱梅真及她的徒弟梁飞熊的帮助。在他们的帮助下，达摩祖师最终在嵩山少林寺出家为僧，并创立了禅宗佛教。故事中还穿插了达摩祖师与梁飞熊之间的师徒情深，以及达摩祖师对佛教教义的深刻领悟和传授。整个故事充满了传奇色彩，表达了追求真理、正义和善良的信念。