1. 化学结构不同：磷酸三钙是由钙离子和磷酸根离子组成的化合物，化学式为Ca3(PO4)2，而碳酸钙是由钙离子和碳酸根离子组成的化合物，化学式为CaCO3。

2. 硬度不同：磷酸三钙比碳酸钙更硬，因此在口腔牙齿保健产品中常用磷酸三钙作为抛光剂。

3. 溶解性不同：由于碳酸钙是碳酸盐，其溶解性较好，可以在水中溶解成钙离子和碳酸根离子；而磷酸三钙的溶解性较差，需要在酸性环境下才能被溶解。

4. 应用领域不同：碳酸钙广泛应用于工业和食品添加剂中，如制造建筑材料、医药制剂等；而磷酸三钙主要应用于口腔保健产品和饲料添加剂中。