南港码头和新港码头的快慢并没有绝对的答案，因为这取决于不同的情况。一般来说，南港码头由于位置相对更为靠近台北市区，因此对于从市区出发或前往市区的人来说更为便利，交通也相对更为便捷。

而新港码头较为靠近高雄市区，对于南部地区的人而言更为方便，同时也是前往澎湖、金门等海岛的重要出发口岸。因此，要根据具体的出行需求和所在位置来选择使用哪个码头。