这个问题很难给出一个确切的答案，因为药店的利润会受到许多因素的影响，比如所在地区、经营规模、店铺装修、货品种类、市场竞争等等。但是，我们可以从以下几个方面来探讨：

经营收入：

药店的经营收入通常来自于销售药品、医疗器械、保健品、化妆品等。不同品类的产品利润率和销售量都不同，因此经营收入也会有所差异。按照国内药店行业的平均利润率，在50平米的药店中，全年经营收入可能在500万元左右。但是具体取决于药店所在地的市场需求、竞争情况等。

运营成本：

药店的运营成本包括房租、人工成本、采购成本、运输成本、设备维护成本、税费等。这些成本通常会占到总收入的30%-50%左右。比如，一个50平米的药店，每个月的房租可能在1.5万元左右。人工成本也会因人数、薪水等不同而有所不同。采购成本则受到商品选择、进货渠道等影响。

净利润：

净利润是药店经营的最终目标，也是评估一个药店经营情况的重要指标。净利润=经营收入-运营成本。在运营成本占到总收入的30%-50%的情况下，一个药店的净利润可能在150万元左右。

总结：

虽然我们无法给出一个精确的数字，但可以看到，一个50平米的药店一年的净利润会受到诸多因素的影响。要想增加药店的盈利，应该从提高经营效率、优化采购渠道、提高产品质量等方面入手，提高经营管理水平。