如果电瓶车是因为违章被扣，那么根据相关法律规定，拖车费是由车主承担的，因此要支付拖车费是合法的。但如果电瓶车未违法而被扣，那么就需要向相关部门进行申诉和维权。无论何种情况，合法权益受到侵害的车主都有权利进行维权。