水霉病得病原因大多是捞捕、运输观赏鱼时，稍为不慎，使鱼体皮肤受伤，或寄生虫侵袭破坏皮肤，霉菌的孢子侵入伤口，吸取养料，迅速萌发，菌丝一端向内深入肌肉，一端向外生长，形成棉絮状菌丝。

霉菌刚寄生时，肉眼不易发现；待肉眼见到时，菌丝已从鱼体伤口侵入，由外向内生长。