氨基寡聚糖与氨基寡糖素虽有一定的相似性，但它们在结构和功能上存在明显的差异。氨基寡聚糖是一种天然存在的多糖，由多个单糖通过糖苷键连接而成，具有多种生物学功能，如细胞识别、免疫调节等。

而氨基寡糖素，特别是农业级壳寡糖，则更侧重于在农业领域的应用，它能对病菌生长产生抑制作用，促进植物生长发育，并具有营养、调节、解毒等多重功效。简言之，氨基寡聚糖更广泛涉及生物体的各种功能，而氨基寡糖素则更专注于农业应用与植物保护。