根据相关法律规定,违章单应该在违章发生地或者车辆注册地所在地的交通管理部门办理。因此,江门蓬江区违章单应该在江门市蓬江区交通运输局办理,并不能在江海区办理。如果到江海区进行处理,可能会被告知需要到蓬江区办理,造成时间和精力的浪费。建议车主在收到违章单后,及时到违章发生地或者车辆注册地所在地的交通管理部门进行处理,以免造成不必要的麻烦。