马岛獴的生殖过程与其他哺乳动物类似，雌雄交配后，在雌性体内受精并形成受精卵。受精卵随后进入子宫，接着受精卵开始分化和增殖，在子宫内发育成胎儿。胎儿约在70到80天后出生，依靠母亲哺乳长大。马岛獴一般成对栖息，繁殖能力较强，在充分的生活环境下，每年能繁殖1-2窝，每窝约2-3只幼崽。由于生态环境的破坏，这种珍贵的动物正面临着濒危的现状，需要人们的保护和关注。