直通车限额10元的设置方法是通过对入场口、出场口以及车站之间的信息进行控制，使得每辆车在停靠时只能够进出有限时间，并且只收取10元以下的费用。

同时，系统也要实时监测车站的人流量，以及车辆之间的间隔时间，保证整个系统的运营效率和安全性。

这样的设置方法对于城市的交通拥堵、环保减排等方面都有很大的促进作用，可以带来更加便捷和舒适的出行体验。

值得一提的是，这个方法也需要不断优化和完善，以满足市民日益增长的出行需求。