如果您的门诊病历原件被厂里拿走了，您可以采取以下措施：

与厂里沟通：首先，尝试与厂里负责人或相关人员沟通，了解他们拿走病历原件的原因。可能是因为他们需要了解您的病情，或者是为了办理工伤认定等手续。请您明确表示自己的担忧，如隐私保护、可能产生的法律纠纷等，并要求他们尽快归还病历原件。

保留复印件：如果厂里需要病历原件办理相关手续，您可以提供病历复印件。在复印件上注明“此复印件仅供厂里办理相关手续使用，不得用作其他用途”，并保留复印件的副本。这样既可以满足厂里的需求，又可以确保自己的权益。

寻求法律帮助：如果您与厂里沟通无果，或者担心病历原件被用于其他不当用途，您可以寻求法律帮助。咨询律师，了解您的权益和可能的解决方案。如有必要，可以向法院提起诉讼，要求厂里归还病历原件并赔偿损失。

向医疗机构补办病历：如果您的病历原件确实无法追回，您可以向就诊的医疗机构咨询是否可以补办病历。有些医疗机构可能会提供病历复印件或重新出具诊断证明，以便您在后续处理中使用。