长期备份文件的最佳选择是移动硬盘。虽然U盘更便宜和便携，但由于长期使用和频繁插拔易造成数据损坏，容量也有限。

相比之下，移动硬盘更大容量、更耐用，也有更好的散热设计和更高的稳定性，能更好地保护数据。另外，建议选择可靠品牌和购买尽可能大容量的移动硬盘，以保障数据的完整性和可靠性。