区别如下:

头部区别 大鳄的头比较尖,小鳄龟的头比较圆。大鳄龟上颌似鹰嘴状,钩大,小鳄龟上颌似钩状,但钩小。大鳄龟能扭头突然袭击其它动物,小鳄龟能连同身体扭头转向寻找攻击目标,甚至追咬。

嘴部区别 大鳄龟的嘴部比小鳄龟的要长,舌头为红色的结构,小鳄龟则没有这些特征。

背甲区别 大鳄龟的背甲甲峰很明显,而小鳄龟的甲峰则不明显,近乎平背,背甲看起来比较圆。大鳄龟的背甲上有3条凸起的纵走棱脊,褐色,每块盾片均有突起物,腹甲棕色,具上缘盾,小鳄龟的背甲棕黄色或黑褐色,有3条纵行棱脊,肋盾略隆起,随着时间推移棱脊逐渐磨耗。

腹部区别 大鳄龟的腹部有无数触须,小鳄龟的的腹部仅有少量触须,腹甲灰白色,无上缘盾。