线粒体是细胞内能量生产的关键器官，其中电子传递链是实现细胞呼吸作用的重要步骤，但并非所有分子都参与电子传递。

不参与电子传递的分子包括线粒体内膜上的ATP酶，它是线粒体内ATP合成的关键酶，不会参与电子传递。

此外，线粒体外膜上的复合物也不参与电子传递，它具有物质转运的功能，将线粒体外物质转移到细胞质中。以上是不参与线粒体内膜上的电子传递的两个主要分子。