大运河马拉松是因为其比赛路线穿越了中国的京杭大运河而得名。京杭大运河是一条古代贯穿中国北方的人工运河，全长约1794公里，自北京通往杭州，连接了黄河和长江两大水系，并穿越了北京、天津、河北、山东、江苏、浙江等多个省市。

大运河马拉松的比赛路线从扬州市南京浦口大桥起点开始，沿着京杭大运河向南延伸，经过镇江、丹阳、常州、无锡、苏州、上海等地，终点在杭州市的钱塘江畔。整个比赛路线总长约42.195千米，选手可以欣赏到京杭大运河风光秀美的风景线，也感受到了这条古老运河的历史及地域文化的悠久魅力。

因此，"大运河马拉松"这个名称与比赛路线紧密相关，表达了比赛通过京杭大运河这一重要历史文化遗产，展现出了中国的文化底蕴和旅游资源，同时也让参赛者在比赛中体验到历史和现代的结合。