山楂树的主干在栽种时通常会留一个适当高度。一般来说，为了方便管理和促进山楂树的生长，树木的主干留高约1.5米到2米左右比较合适。这样留下的主干高度能够在保持树木稳定性的同时，也有利于分枝和果实的生长，促进整棵树的健康成长。不过具体主干留多高也要根据实际情况和栽植目的来综合考虑。