如果新农合交晚了，且住院费用已经产生，需要及时联系当地的新农合管理部门进行沟通，了解相关的补偿政策和申请流程。同时准备好相关的费用发票和其他证明材料，提交给新农合管理部门审核，以便顺利获得报销。在日后，一定要按时交纳新农合费用，以免再次出现交晚而导致的报销问题。