交强险只要有责任，就要按照规定进行赔付。如果医疗费用在10000元内，保险公司是需要报销所有的费用的，包括门诊、住院、抢救以及营养费等，所以是不能扣除自费药的费用的。不过具体还是要看保险公司的规定，如果对赔付有异议的话可以去保监会进行投诉。