导航货车可以通过高速公路收费站的ETC（电子不停车收费）系统自动扣费。ETC系统利用车辆上装置的电子标签扫描，自动向车主的预付费账户扣除过路费。如果车辆没有安装ETC标签，可以在收费站找到对应的人工车道进行缴费。

另外，现代化的导航系统也可以提供即时的过路费信息和路况状况，帮助司机规划自己的行驶路线和预计到达时间。