劳动仲裁申请书中的社保补偿费用部分应当包括详细描述双方的社保缴费情况，列出应缴金额和实际缴费金额之间的差额，并说明未及时缴纳导致的影响。同时，附上相关证明材料，如社保缴费证明、银行流水等，以便仲裁委员会审核。

最终目的是让劳动者获得应有的社保权益，实现公平的劳动关系。