微生物菌剂是一类含有活性微生物的制剂，这些微生物在农业上用于促进植物生长、防治病害、改善土壤结构和提高肥料利用率等。微生物菌剂中的微生物可以是细菌、真菌、放线菌等，它们通过与植物根系共生、拮抗病原微生物、固定氮、分解有机质等作用来发挥作用。

多菌灵是一种广谱性杀菌剂，属于苯醚甲环唑类化合物，主要用于防治多种植物病害，如灰霉病、白粉病、叶斑病等。多菌灵通过抑制病原菌的细胞分裂和生长来控制病害的发生和发展。它是一种化学农药，与微生物菌剂的生物活性成分不同。

总结来说，微生物菌剂是基于活的微生物来发挥作用的生物制剂，而多菌灵是一种化学合成的杀菌剂。两者在农业生产中都有广泛应用，但它们的作用机制、来源、使用方法及对环境和人类健康的影响各不相同。