小时达单门店与连锁店的主要区别在于运营模式和规模。单门店通常规模较小，运营相对独立，主要服务于周边地区，商品种类和数量有限。而连锁店则是由多个门店组成，规模较大，可以实现统一采购、统一配送、统一管理，商品种类和数量更加丰富，且可以通过品牌效应吸引更多消费者。

此外，在运营策略和服务质量方面，连锁店通常更有优势，能够提供更好的购物体验和售后服务。因此，在选择购物方式时，消费者可以根据自己的需求和喜好选择适合自己的门店类型。