房产证上父亲和儿子各持有50%的产权，如果父亲想要将其名下的50%产权过户给儿子，具体的费用可能因地区和具体情况而异。一般来说，过户涉及的费用主要包括契税、个人所得税、公证费和工本费等。

以契税为例，如果是直系亲属间的赠与过户，契税可能会有一定的优惠，但具体的税率还是需要根据当地的政策来确定。个人所得税方面，如果父亲在过户时没有获得任何现金或其他形式的收益，那么可能不需要缴纳个人所得税。公证费和工本费则通常是按照固定的标准来收取的。

总之，如果父亲想要将其名下的房产证过户给儿子，最好先咨询当地的房产交易中介或相关部门，了解具体的过户流程和费用情况。同时，还需要注意确保过户过程的合法性和规范性，避免出现不必要的纠纷。