梧桐山站：位于罗湖区罗沙路北侧，车站横跨公交集团地块及梧桐山国家风景管理区，为地下两层岛式站台车站。
沙头角站：位于深盐路与园林路交叉口处，沿深盐路东西向布置，为地下两层局部三层岛式站台车站。
海山站：位于盐田区深盐路，香径南街与海山路之间，为地下两层岛式站台车站。
盐田港站：位于盐田区深盐路与海景二路交叉口西侧，东部阳光花园小区和威明电子有限公司之间，为地下两层岛式站台车站。
深外站：起于深圳外国语学校西侧山体，向东北方向下穿中青一路布置，敷设至梧桐山大道前，为地下两层岛式站台车站。
盐田路站：位于盐田区盐田路与东海道交叉口西侧，北部富基金港小区和佳兆业停车场之间，为地下两层双岛四线式站台车站。