M6螺丝孔配合导向的长度应该根据实际情况来确定。通常情况下，如果孔长过短，会导致螺丝松动，从而影响连接件的稳定性；而孔长过长，则会使螺丝头抵达底部时过早，同样会影响连接件的稳定性。因此，需要根据需要连接的部件来选择合适的导向长度。在选择时，可以考虑加入适当的余量，以确保连接件的正确安装和稳定性。