1.对象不同：公诉的对象是违法犯罪行为的犯罪嫌疑人或被告人，而公益诉讼的对象是侵害公共利益和社会公共利益的行为。

2.目的不同：公诉的目的是为了维护社会公共秩序、保障社会公共安全、保护人民群众的合法权益，而公益诉讼的目的是为了保护公共利益、维护社会公共秩序、促进社会公正。

3.程序不同：公诉的程序是由检察机关提出起诉，经过法院审理后作出判决，而公益诉讼的程序是由符合条件的社会团体或者人民检察院提起，经过法院审理并判决后，判决生效后，由社会团体执行。

总的来说，公诉和公益诉讼都是司法机关利用法律手段保护社会公共利益和合法权益的重要途径，但在对象、目的和程序方面存在不同。