跑药店销售和医院销售的主要区别在于销售的渠道和销售方式。具体来说：1. 销售渠道不同：跑药店销售主要通过药店、超市等零售渠道实现，而医院销售主要通过医院的门诊、急诊、住院等渠道实现。

2. 销售方式不同：跑药店销售是由药店销售人员主动接待顾客，顾客可以自行选择药品并进行购买。而医院销售则是由医生或护士根据患者的病情和需要进行开药，并由药房配药后交给患者或家属。

3. 销售对象不同：跑药店销售的主要对象是普通消费者，而医院销售的主要对象是患者或家属。

4. 药品品种不同：跑药店销售的药品种类相对较多，包括处方药、非处方药、保健品等。而医院销售的药品主要是处方药，按照医生的处方进行销售。

总的来说，跑药店销售和医院销售的区别在于销售的渠道、方式、对象和药品品种等方面，但它们的共同目的都是为了提供药品和服务，满足消费者和患者的需求。